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Recientemente se ha reportado que el factor de respuesta al suero (SRF) 19 y la miocardina (MYOCD) 20, 21, dos factores de transcripción que interactúan entre si y controlan la diferenciación de VSMC, se encuentran sobre expresados en el Alzheimer produciendo una hipercontracción de las VSMC, en pequeñas arterias cerebrales a través de la expresión directa de los genes contráctiles regulados por la interacción SRF–MYOCD [1]. La miocardina es una proteína normal necesaria para el desarrollo del corazón y las funciones coronarias, sin embargo su sobre expresión está asociada con el Alzheimer [1].

Existen algunas medicinas que impiden la producción de miocardina, las cuales actualmente se usan para tratar enfermedades coronarias y no en el tratamiento del Alzheimer. Un ejemplo importante es la Pravastatina conocida en el mercado como Pravachol® [2], que es usada como agente disminuyente de colesterol y pertenece a la clase de medicamentos conocidos como estatinas. Este medicamento es utilizado principalmente para el tratamiento de la Dislipidemia y la prevención de enfermedades cardiovasculares. 

Para este estudio, se realizó un modelo de interacción y el reporte de posibles sitios de unión de la Pravastatina en la proteína Miocardina. Para esto se utilizó la secuencia fasta de la proteína  “myocardin [Homo sapiens])” encontrada en NCBI con el ID de GenBank: AAV33439.1. Como La estructura cristalográfica de la miocardina no se encontraba disponible, se utilizó un modelo en 3D (Fig. 1), que fue evaluado con la herramienta Swiss-Model Workspace, que provee un reporte, del cual se utilizaron los resultados de PROCHECK.

La estructura de la droga Pravastatina (Fig. 1), junto con todas las propiedades químicas y físicas, fueron extraídas de DrugBank, con el ID de acceso DB00175 (APRD00328). Luego de tener las estructuras, se buscaron los sitios de unión utilizando Pocket-Finder, se determinaron los patrones de plegado de la proteína miocardina haciendo uso del programa PFP-Pred y para predecir las posibles flexibilidades de la macromolécula, fue utilizado el Elastic Network Model (El Nemo), con el fin de medir las flexibilidades de la pravastatina en la unión a la proteína miocardina (miocardina [Homo sapiens]) durante simulaciones de acoplamiento (Docking). El acoplamiento (Docking) se realizó con el programa Hex Protein Docking Server, para posterior análisis en base a la bibliografía y datos obtenidos con este estudio. 

Están de acuerdo con que se publique en el sitio del 1er Congreso Virtual de Ciencias Morfológicas (Morfo 2012)